Фамилия Амалицкая — редкий случай, когда географическое происхождение почти наверняка перевешивает любые другие версии. Она образована по польско-украинской модели с суффиксом -цк-, который в женском роде даёт окончание -ая. В русской традиции фамилии на -ский/-цкий обычно указывают на дворянское происхождение или на связь с местностью, но в данном случае речь, скорее всего, не о титуле, а о топониме.

Основа фамилии — Амалиц- — восходит к названию населённого пункта. На карте бывшей Речи Посполитой есть несколько мест с корнем «Амаль» или «Амали», например, деревня Амаличи (Омаличи) на территории современной Беларуси или историческое местечко Амаль в Литве. Житель такого места получал прозвище Амалицкий — «тот, кто из Амалича». Со временем прозвище закрепилось как фамилия, а женская форма Амалицкая возникла по правилам русского языка для обозначения жены или дочери носителя фамилии.

Вторая версия, менее вероятная, но встречающаяся в любительских словарях, выводит фамилию от немецкого имени Амалия. Однако для образования фамилии на -цкий от женского имени нет убедительных словообразовательных моделей в славянских языках. Если бы предка звали Амалией, фамилия звучала бы как Амальин или Амалькина. Поэтому гипотеза с топонимом остаётся основной.

С точки зрения сословной истории, фамилии на -цкий в XIX веке часто носили представители польской шляхты, но не обязательно — их могли получить и крестьяне, переселившиеся из одной деревни в другую и записанные по месту прежнего жительства. Амалицкие, скорее всего, происходят из западнорусских земель (современные Беларусь, Украина, Литва), где фамилии с таким суффиксом были распространены шире, чем в центральной России. Встречаемость фамилии крайне низкая, что подтверждает её локальное происхождение: носители, вероятно, ведут род из одного или двух соседних сёл.