Фамилия Амраен — редкая, и её происхождение неочевидно для русского уха. В ней нет привычных славянских суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу указывает на иноязычную основу. Скорее всего, перед нами фамилия, адаптированная к русской графике, но сохранившая корни из другого языка.

Наиболее вероятная версия связывает Амраен с армянским именем Амраен (Ամրայեն), которое восходит к слову «амра» — «сильный, крепкий». В армянской ономастике фамилии часто образовывались от личных имён с помощью суффикса -ен (или -ян, -енц), указывающего на принадлежность: «из рода Амра». Таким образом, Амраен могло означать «потомок Амра» или «относящийся к Амраю». Подобная модель типична для армянских фамилий, которые нередко заканчиваются на -ян, -ен, -унц.

Есть и другая, менее распространённая гипотеза. В некоторых тюркских языках существует имя Амра (вариант Амрах), означающее «благополучный, счастливый». Если фамилия пришла из этой среды, то суффикс -ен мог быть прибавлен при русификации, по аналогии с украинскими или польскими фамилиями (например, Амраенко). Но это предположение слабее: отсутствие типичных тюркских суффиксов ( -ов, -ев ) делает армянскую версию более логичной.

Географически фамилия Амраен встречается в основном на юге России и в Закавказье, что подтверждает её армянские корни. В исторических записях она не частотна, поэтому сословную принадлежность предков установить трудно: носителями могли быть и ремесленники, и крестьяне, и священнослужители — точных данных нет.

Написание фамилии с двумя «а» подряд (Амраен, а не Амраян) — это, вероятно, результат адаптации к русской письменности, где сочетание «ае» встречается реже, чем «ая». В армянском оригинале могло быть Ամրայեն, что при транслитерации дало бы «Амраен» или «Амраян». Разница в написании не меняет сути: фамилия остаётся редким свидетельством миграции имён из армянской среды в русский быт.