Фамилия Анамалиева — редкий случай, когда географический и языковой следы ведут в одну точку почти без вариантов. Её основа — мужское имя Анамали, а суффикс -ев указывает на русскую модель образования фамилий от отчества. В таком виде фамилия характерна для народов Дагестана и, шире, для тюркоязычных регионов Кавказа, где имя Анамали встречается до сих пор.

Имя Анамали — составное. Первая часть, «Ана», в тюркских языках означает «мать». Вторая — «Али» — арабское имя, одно из имён Аллаха и зятя пророка Мухаммеда, широко распространённое у мусульман. В буквальном прочтении имя звучит как «Мать Али» — непривычно для русского уха, но в культурах, где имя могло даваться в честь матери или по обету, такие конструкции не редкость. Встречается вариант Анамали и как самостоятельная фамилия без суффикса, особенно у азербайджанцев и народов Дагестана.

Русский суффикс -ев (а не -ов) появился из-за мягкого окончания основы: Анамали заканчивается на «и», и по правилам русского языка притяжательный суффикс даёт форму Анамалиев. Окончание -а — женский род, то есть Анамалиева — это «жена или дочь Анамали». Мужской вариант, Анамалиев, встречается реже, но логически первичен.

Сословного барьера у фамилии не было: её могли носить и крестьяне, и горожане, и духовные лица. В дореволюционных записях по Дагестану и Закавказью фамилия фиксируется с конца XIX века, когда у местных народов начали массово оформлять русские патронимические фамилии. До этого люди обходились именем и указанием на отца или род.

Спорных версий происхождения немного. Иногда первую часть «Ана» ошибочно связывают с греческим «ана» (вверх) или с русским «ана» как частью слова «анатомия» — это лингвистически несостоятельно. Единственная реалистичная альтернатива: если имя Анамали — не от «мать», а от тюркского «ана» в значении «родной, кровный» (в некоторых диалектах). Но и тогда смысл остаётся в кругу семейных прозвищ.

Сегодня фамилия Анамалиева встречается в основном в Дагестане, Чечне, Азербайджане, а также в среде выходцев из этих регионов в крупных городах России. Из-за редкости она хорошо сохраняет родовую память: почти каждый носитель знает, что фамилия пошла от конкретного предка по имени Анамали.