Фамилия Аниханов — редкий случай, когда написание точнее произношения. На слух её чаще воспринимают как «Аниканов» или «Ониканов», и именно так ошибаются при записи. Но буква «х» в корне не случайна: она прямо указывает на основу «Анихан», которая восходит к тюркскому составному имени. Первая часть, «Ан», может означать «сознание», «память» либо быть вариантом имени Ануш («сладкий», «приятный»). Вторая часть — «хан», титул правителя, который в составе личных имён был распространён у татар, башкир, казахов и народов Кавказа. В прошлом «хан» в имени не обязательно указывал на знатное происхождение — скорее на пожелание силы и уважения.

Суффикс -ов стандартно образует патроним: Аниханов буквально значит «сын Анихана» или «потомок Анихана». Если бы фамилия писалась как Аниканов, её легко было бы возвести к крестильному имени Иоанникий (в просторечии Аника) — греческому имени со значением «победитель». Но форма именно через «х» отсылает к тюркскому, а не к православному календарю. В русских говорах, особенно на севере и в Поволжье, фамилии с корнем «Аних-» встречаются, но редко; чаще попадаются однокоренные Анихины и Анихаевы.

Фамилия не принадлежит к числу дворянских и не фиксируется в старых родословных книгах — это поздняя крестьянская или мещанская фамилия, оформившаяся в XIX веке, когда крепостным крестьянам массово давали фамилии по отцу. Географически Анихановы чаще встречаются в Татарстане, Башкортостане и Оренбуржье — регионах, где веками жили тюркские народы в соседстве с русскими. Возможно, предок носителя фамилии был крещёным татарином или башкиром, взявшим фамилию по отцу-мусульманину. Написание через «х» — не ошибка, а точная запись исходного имени, которую стоит сохранять, чтобы не потерять след в истории рода.