Фамилия Аниксон — редкий пример отчества, образованного не от полной, а от краткой формы имени. В её основе лежит имя Аникей, народный вариант канонического имени Иоанникий (от греческого «победа»). В быту Аникея часто называли просто Аник, и вот от этого сокращённого варианта и пошла фамилия. Суффикс -сон, а не привычное русское -ов или -ин, сразу выдаёт её происхождение: это типичная модель для фамилий, сложившихся в среде немецких колонистов или еврейского населения западных губерний Российской империи. В русском языке такое окончание нехарактерно, а вот в немецком или идише оно означает «сын»: Аниксон — буквально «сын Аника».

По сути, Аниксон — это калька с русского отчества «Аникиевич» или «Аниконович», только записанная на иностранный лад. Такие фамилии возникали в XVIII–XIX веках, когда при переселении или оформлении документов в многонациональных регионах (Прибалтика, Новороссия, Поволжье) имя или прозвище отца переделывали по модели местного языка. Поэтому предки носителей этой фамилии с большой вероятностью жили на стыке культур — либо в немецких колониях, либо в черте оседлости, где идиш был разговорным языком.

Двойственность заметна и в ударении. В русском языке фамилию чаще произносят с ударением на первый слог — А́никсон, что совпадает с ударением в имени Аник. Но по правилам немецкого или еврейского произношения ударение может падать на последний слог: Аниксо́н. Оба варианта встречаются, и это добавляет путаницы при поиске корней.

Сравните с однокоренными фамилиями: Аничкин, Анисимов, Аниконов — все они восходят к тому же имени Аникей, но образованы по чисто русским суффиксам. Аниксон стоит особняком: его форма — прямое свидетельство того, что предок носил фамилию не по месту жительства или роду занятий, а по имени отца, но в иноязычной среде. Это не «княжеская» и не «крестьянская» фамилия — она социально нейтральна и скорее указывает на этническую или культурную границу, на которой жила семья.