Фамилия Апананская интересна тем, что её географическая природа почти очевидна, а вот корень ставит в тупик. Это фамилия на -ская, а в русской традиции такой суффикс чаще всего привязывал человека к местности: селу, деревне или урочищу. Значит, предок носительницы фамилии либо владел землёй, либо, что вероятнее, был выходцем из населённого пункта с похожим названием.

Корень «Апанан-» для славянских языков чужой. Скорее всего, он тюркский или финно-угорский. В Поволжье и Приуралье разбросаны топонимы вроде Апанаево, Апанасово, Апанаска. Если исходное название звучало как Апананка или Апанань, фамилия могла закрепиться за переселенцами из тех мест. Менее вероятная версия — связь с именем Апанас (просторечная форма Афанасия). Но для такой модели суффикс -ская нехарактерен: от личных имён обычно образовывали фамилии на -ов или -ин.

Сословие предков остаётся неясным. Фамилии на -ский в России носили дворяне (по названию поместья), духовенство (по приходу) и крестьяне, получившие фамилию после реформы 1861 года по месту прежнего жительства. Для Апананской с нерусским корнем правдоподобнее поздний, крестьянский или мещанский вариант: фамилию дали по деревне, откуда семья перебралась в город.

В современной России фамилия встречается редко, в основном в центральных регионах и на Урале. Написание с окончанием -ая указывает на женский род; мужской вариант — Апананский. Из-за редкости фамилия не попала в крупные ономастические словари, и её точное происхождение остаётся областью догадок, опирающихся на общие закономерности русской фамильной системы.