Фамилия Апанавичюс — классический пример литовской модели образования фамилий на -вичюс. Она происходит от личного имени Апанас, которое является литовской народной формой православного крестильного имени Афанасий (от греческого athanatos — «бессмертный»). Таким образом, в основе лежит отчество: Апанавичюс буквально означает «сын Апанаса».

В литовской антропонимике суффикс -вичюс (или -явичюс) — это типичный патронимический показатель, соответствующий русскому -ович или польскому -ович. До XIX века литовцы в официальных документах часто писались по-польски или по-русски, поэтому фамилия могла фиксироваться в формах Апанович, Апановичюс, а в советское время — как Апанавичюс. Встречаются и укороченные варианты без суффикса, например, Апанас или Апанавичус, но именно форма на -вичюс указывает на принадлежность к литовской языковой среде.

Географически фамилия Апанавичюс сосредоточена в Литве, особенно в юго-восточных регионах (Вильнюсский край, Алитусский район), где исторически было сильное влияние православной традиции и славянских имен. Встречается она и среди литовцев, живущих в Беларуси и Польше. Социально носители этой фамилии в XIX веке чаще всего были крестьянами или мещанами, поскольку литовская знать предпочитала фамилии на -скис.

Стоит отметить, что имя Афанасий в литовском языке дало целое гнездо фамилий: Апанавичюс, Апанава, Апанаска, Апанасик. Все они восходят к одному корню, но различаются суффиксальными моделями. Апанавичюс — одна из самых распространенных в этом ряду, так как патроним на -вичюс был особенно популярен в XIX веке при массовой фиксации фамилий.