Фамилия Апиков внешне проста, но за ней скрывается несколько возможных историй. Корень здесь неочевиден, и версий его происхождения несколько, но все они ведут к прозвищу или имени, которое дало жизнь этой редкой фамилии.

Самая прямая версия — от тюркского имени Апик. В татарском и башкирском языках «апик» (или «апый») — уважительное обращение к старшей сестре или тёте, но в качестве мужского имени оно встречалось реже. Такую основу могло дать и арабское имя Афик, что значит «чистый, искренний». В этом случае фамилия Апиков — типичная патронимическая: «сын Апика». Суффикс -ов указывает на русскую адаптацию, характерную для фамилий крещёных татар или народов Поволжья, которые в XIX веке массово получали такие окончания. Именно эта версия кажется основной, и её поддерживает география: по переписям, основные очаги фамилии — Татарстан, Башкортостан и Оренбургская область.

Есть и другая, менее очевидная, но исторически возможная версия. В русских говорах слово «апика» могло означать «опока» — известняк или глина, идущая на побелку. Прозвище Апика могли дать человеку, который добывал или обжигал известь. Тогда фамилия Апиков — от прозвища по ремеслу. Эта версия объясняет, почему фамилия встречается не только в тюркоязычных регионах, но и в центральных областях России, хотя там она гораздо реже.

Третий вариант — искажённое написание фамилии Опиков. В южнорусских говорах «аканье» было сильным: фамилию могли записать со слуха как Апиков, хотя исходная основа — «опик» (от «опекать», опекун). Но эта гипотеза слабее: в документах фамилия Апиков фиксируется последовательно через «а», а не как вариант написания. Среди носителей нет громких исторических фигур, но сама фамилия — живое свидетельство смешения культур на востоке России.