Фамилия Аполдор сразу ломает привычный шаблон. В ней нет суффиксов -ов, -ин или -ский, которые обычно указывают на отчество или принадлежность. Перед нами готовая основа, что выдаёт её искусственное, книжное происхождение, а не бытовое прозвище.

Скорее всего, Аполдор — это семинарская фамилия-гибрид, собранная из двух греческих корней: «Аполло» (в честь бога Аполлона) и «дор» (δῶρον — «дар»). Буквально — «дар Аполлона». В XVIII–XIX веках в духовных академиях Российской империи было принято давать будущим священникам благозвучные фамилии из античного наследия. Аполдор мог получить сын священника, которого в миру звали Аполлоном, или сам семинарист, пожелавший возвысить свою фамилию. Длинные имена вроде Аполлодор часто усекали для удобства — это типичный почерк семинарского творчества.

Менее вероятная версия — что фамилия восходит к реальному греческому имени Аполлодор (Απολλόδωρος), которое могло попасть в русскую среду через церковные святцы. Однако в святцах это имя встречается редко, а форма «Аполдор» — явное сокращение, что опять же указывает на книжное, а не народное происхождение.

География фамилии узкая. По открытым данным, Аполдоры встречаются в основном на юге России и в Поволжье — в зоне расселения сельского духовенства. Никаких дворянских родов или известных исторических личностей с этой фамилией не зафиксировано, что подтверждает её «учёное» и позднее происхождение. Носитель такой фамилии почти наверняка происходил из семьи священнослужителей, где ценили книжное знание и классическое образование. Это не прозвище и не указание на профессию, а намеренно созданная фамилия с отсылкой к античной культуре.