Фамилия Аптинеева — нечастая, и её происхождение неочевидно. Вопреки ожиданию, в её основе лежит не имя и не ремесло, а диалектное прилагательное, описывающее внешность. Ключевое слово здесь — «апти́ный», южнорусская и украинская форма от «оптный», то есть «сытый, обильный, полный». В говорах «оптный» означало не только сытость, но и дородность, грузность, видную стать. Поэтому прозвище Апти́н давали человеку плотного, крепкого телосложения, основательному и надёжному.

Женская форма фамилии построена по стандартной схеме: к основе мужской фамилии Аптинеев (где суффикс -ев указывает на принадлежность отцу) добавили окончание -а. Буквально это «дочь или жена Аптинеева», а в конечном счёте — «потомок Апти́на». Суффикс -еев здесь закономерен: исходное прозвище Аптин оканчивалось на твёрдый согласный, и при образовании фамилии добавился суффикс -ев, который в некоторых говорах перешёл в -еев (как в фамилиях Тимофеев, Алексеев).

Географически фамилия Аптинеева редка, её основной ареал — юг России, особенно Ростовская и Волгоградская области, где диалектное слово «оптный» было в ходу. Встречается и вариант написания через «о» — Оптинеева, что прямо указывает на акающее произношение.

Попытки связать фамилию со словом «аптека» (от греческого apotheke — склад) неубедительны: тогда бы фамилия звучала как Аптекин или Аптекарев. Не стоит путать её и с тюркским именем Аптин (вариант Абдин) — в таком случае написание было бы через «д» и география была бы иной. Самое правдоподобное объяснение — прозвище по внешнему признаку, закрепившееся в крестьянской среде юга России.