Фамилия Аптыков образована от прозвища Аптык, которое восходит к киргизскому слову «аптык». На русский язык «аптык» переводится как «запинаться в словах (от волнения, от сильной одышки)». Вполне вероятно, что это прозвище указывало как на черты характера предка, так и на состояние его здоровья. По другой версии, в основе данной фамилии лежит татарское имя Аптык, которое имеет персидское происхождение и на русский язык переводится как «неделя», «семерица». В этом случае возможно, что основатель рода Аптыковых был долгожданным ребенком в семье.