Фамилия Апухтина — один из тех случаев, когда написание через «а» закрепилось в официальных документах, хотя исходная форма звучала иначе. В основе лежит прозвище Опухта. В рязанских говорах так называли опухшего, одутловатого человека — слово прямое и описательное, без иносказаний. Прозвище давали по внешней примете, и оно не несло оскорбительного оттенка: в старину такие бытовые характеристики были обычным делом.

Первым документально известным носителем стал Федор Юрьевич Опухта, живший в начале XVI века. Именно он считается родоначальником фамилии Апухтиных. Позже, в 1612 году, в Болхове упоминается Азей Лукьянович Опухтин. Фамилия оформилась по стандартной модели: к основе Опухт- добавили суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Опухты). Со временем безударное начальное «о» в произношении перешло в «а», и написание подстроилось под звучание — так появились Апухтины.

Фамилия относится к древнему дворянскому роду, но по происхождению своему она чисто прозвищная, а не «княжеская» или «географическая». Это типичная русская фамилия на -ин, образованная от личного прозвища, и её разгадка лежит не в географии, а в диалектной лексике Рязанщины.