Фамилию Ардуханян стоит начать разбирать с её самого узнаваемого элемента — суффикса. Конечное -ян — это армянский патронимический маркер, который работает как русское «-ов» или «-ин»: он указывает на принадлежность к роду, на происхождение «из семьи такого-то». В армянском языке этот суффикс сохранился в исходном виде, без перехода в «-ов/-ев», что сразу выдаёт национальные корни фамилии. Встречаются и усечённые варианты — Ардухан, но это скорее исключения, характерные для диаспоры.

Основа фамилии — составное слово «Ардухан». Первая часть, «Ард», восходит к армянскому «ард» — «поле», «пашня», «равнина» или «обрабатываемый участок». В древнеармянском это слово имело конкретное хозяйственное значение и не несло абстрактных смыслов. Вторая часть, «ухан», сложнее. Наиболее вероятная версия — это искажённое «Ован» (армянский вариант имени Иоанн, то есть Иван). Тогда «Ардухан» означает «потомок Арда с именем Ован» — то есть земледелец по имени Ован. Менее вероятно, но возможно тюркское влияние, где «ухан» означало «понимающий», «знающий» — тогда фамилия могла бы читаться как «потомок того, кто понимает поле», но армянские фамилии редко строятся на абстрактных качествах, предпочитая конкретные объекты.

Географически фамилия тяготеет к западу исторической Армении — к районам вокруг озера Ван и Эрзурума (ныне восток Турции). Там армянские фамилии с основой «Ард» встречаются чаще, и не исключено, что Ардухан — это название села или местности, откуда пошёл род. В современной Армении фамилия редкая, но встречается в диаспоре — в России, США, Франции.

С социальной точки зрения носители фамилии, скорее всего, не принадлежали к высшей знати. Армянские фамилии на «Ард» обычно указывали на крестьян-земледельцев или мелких землевладельцев (меликов), но не на княжеские роды. Однако это не делает фамилию менее ценной: она прямо и прозрачно говорит о занятии предка — обработке земли. В отличие от многих русских фамилий, которые со временем теряют связь с профессией, Ардуханян остаётся «полевой» фамилией.

Спорных версий немного. Встречается попытка связать «Ард» с древнеперсидским «арта» (истина, порядок) — но это натяжка: в армянском языке этот корень не закрепился, а для персидского фамилия нехарактерна. Более правдоподобно, что «Ард» — это просто земля, и фамилия описывает реальное занятие предка.