Фамилия Атапков — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет прозрачного корня, как, например, в Кузнецове или Попове, поэтому разбирать её стоит через словообразовательную модель и сопоставление с другими фамилиями.

Основа Атапк- с суффиксом -ов указывает на типичную русскую модель отчества: предка звали Атапко. Вторая часть — -ко — уменьшительно-ласкательный суффикс, широко распространённый на Украине и в южнорусских говорах (сравните: Шевченко, Коваленко). Значит, фамилия Атапков — это русифицированная форма украинской или белорусской фамилии Атапко, которую при переселении в великорусские губернии подогнали под местную норму, добавив -ов.

Что за имя или прозвище Атапко? Точного ответа нет, но лингвисты предлагают две основные версии. Первая: это вариант имени Евстафий в его народной форме. В украинских говорах Евстафий превращался в Остап, а от него — в Атап (через аканье). Тогда Атапко — производное от Атап, то есть «маленький Атап» или «сын Атапа». Вторая версия: связь с тюркским словом «ата» — отец, предок. В таком случае Атап могло быть прозвищем старшего в роду или уважаемого человека, а Атапко — его потомок.

География фамилии подсказывает, что правдоподобнее первая версия. Атапковы встречаются в основном в центральных и южных областях России — в Курской, Белгородской, Воронежской, а также в Поволжье. Это те регионы, куда активно переселялись украинские крестьяне в XVII–XIX веках, принося с собой свои фамильные формы. В документах XIX века фамилия фиксируется в среде государственных крестьян и однодворцев — потомков служилых людей, охранявших южные границы.

Таким образом, носитель фамилии Атапков, скорее всего, потомок человека по имени Атап (народная форма Евстафия) или, реже, обладателя прозвища, данного за почтенный возраст. Фамилия сохранила след давнего смешения языков и культур на южных рубежах России.