Фамилия Атконов — редкая, и её происхождение неочевидно. На первый взгляд она похожа на типичную русскую фамилию с суффиксом -ов, но искать славянскую основу здесь бесполезно. Суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), а основа «Аткон» — это личное имя или прозвище, которого в русском языке нет. Чтобы понять значение, нужно обратиться к ономастике тюркских народов.

Скорее всего, «Аткон» — русифицированная форма тюркского имени Аткан или Аткун. В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) корень «ат» означает «лошадь», «конь», а «кан» — «кровь» или суффикс принадлежности. Имя Аткан могло означать «конник», «всадник», «тот, кто на коне». Встречается и вариант Аткун — «лошадиная кровь» (как метафора силы и выносливости) или «рождённый от коня» (в мифологическом контексте). Такая модель образования имени — от названия животного с добавлением качественной характеристики — типична для тюркской антропонимии. Предки современного Атконова с высокой долей вероятности были конными воинами, табунщиками или просто людьми, чьё прозвище было связано с лошадьми.

Вторая, менее вероятная, версия отсылает к финно-угорским языкам. В коми-пермяцком или удмуртском есть слово «ат» — «отец», а «кон» — «дом». Тогда Аткон могло означать «отчий дом» или «хозяин дома». Но эта гипотеза слабее: фамилии на -ов у финно-угров встречаются реже, чем у тюрков, и обычно образуются от русских имён, а не от местных основ.

Географически фамилия Атконов тяготеет к регионам, где исторически смешивались тюркское и русское население: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область, а также Северный Кавказ (особенно среди ногайцев или кумыков). В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках такая фамилия почти не встречается — это говорит о её поздней фиксации, возможно, уже в советское время, когда многие тюркские фамилии получили стандартное окончание -ов. Фамилия не имеет отношения к дворянским родам или известным историческим личностям — она из разряда тех, что возникли в крестьянской или казачьей среде на стыке культур.