Фамилия Атнишкин ставит в тупик при первом взгляде: ни корня-ремесла, ни привычного имени вроде Ивана или Кузьмы. Разгадка лежит не в славянском, а в тюркском языковом пласте. В основе лежит личное имя Атниш (или Атныш), которое образовано от двух тюркских компонентов: «ат» — «конь, лошадь» (а также «имя») и суффикса «-ниш» (или «-ныш») с уменьшительно-ласкательным или принадлежным значением. Атниш переводится как «конёк» или «лошадка» — типичное для тюркской ономастики прозвище. В кочевой культуре конь был символом статуса, силы и богатства, поэтому такое имя давали ребенку с пожеланием этих качеств.

Суффикс -ин в фамилии — стандартный русский патронимический показатель, отвечающий на вопрос «чей?»: «сын Атниша». Географически фамилия тяготеет к регионам исторического смешения русского и тюркского населения: Поволжье (Татарстан, Башкирия, бывшая Казанская губерния), а также южные области России. Встречается она крайне редко, что говорит о локальном происхождении от одного или нескольких родов. В дореволюционных метрических книгах можно найти единичные записи о крестьянах и мещанах с этой фамилией — дворянского происхождения здесь нет, перед нами фамилия крестьянского или однодворческого сословия.

Интересная деталь: в некоторых говорах фамилию могли записывать на слух как Отнишкин или Атнышкин. Вариант с буквой «ш» (Атнишкин) вместо ожидаемого «Атнисин» (от Атнис) — следствие диалектной мягкости или аканья, когда «с» перед «к» перешло в «ш». Таким образом, носитель фамилии Атнишкин с высокой вероятностью — потомок человека по имени Атниш, крещеного татарина, башкира или чуваша, который жил в среде русского крестьянства и получил фамилию по отцу на русский манер.