Фамилия Атюкина — женская форма от Атюкин, и её происхождение не лежит на поверхности. В основе лежит прозвище или некалендарное имя Атюка. Суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — сын Атюки), а корень «Атюк-» требует разбора.

Самая правдоподобная версия ведёт к глаголу «атькать» или «атукать» — так в старину называли охотничий крик, которым травили зверя («ату его!»). Человек, покрикивавший на собак или руководивший загоном, мог получить прозвище Атюка. Охотничий промысел кормил многие семьи, особенно в северных и центральных губерниях, — там такая основа и встречалась чаще.

Вторая версия, менее вероятная, выводит фамилию из тюркского имени Атюк (уменьшительное от Ата — «отец, предок»). Но фонетика фамилии — ударение на «ю», мягкое «т» — типична для русских диалектов, а не для тюркских заимствований. Если бы корень был тюркским, мы бы скорее увидели форму Атукин или Атакин.

Интересная деталь: суффикс -ин — один из самых распространённых в русских фамилиях, но он редко крепится к глагольным основам. Обычно -ин добавляют к словам на -а/-я (Пушкин — от Пушка). Здесь же прозвище на -а (Атюка) дало фамилию напрямую, минуя отчество от крестильного имени. Значит, предка знали именно по занятию или повадке, а не по отцу.

Фамилия недворянская, скорее крестьянская или мещанская. Встречается в основном в центральной России; единичные записи XIX века есть в архивных документах Тульской и Рязанской губерний.