Фамилия Ауганов образована от имени Ауган. По одной из версий, оно берет начало от древнетюркского нарицательного «оуган» со значением «бог». Существует и другая версия значения имени Ауган. Оно может быть связано с древнетюркским существительным «ауган» со значением «скрываюшийся». Таким образом, потомок человека, которого звали Ауган, со временем получил фамилию Ауганов. Тюркский корень -огло/-оглу/-оглы (в переводе «потомок, сын») типичен для турецких, гагаузских и прочих тюркских фамилий. Представители фамилии Аугановых внесены в различные Памятные книги. Так, в Книге памяти Омской области упоминаются Жусуп Ауганов, родившийся в 1920 году в ауле Сигизбай Азовского района Омской области, Зайныш Ауганов, родившийся в 1900 году в ауле Дюсембай Шербакульского района Омской области.