Фамилия Айгельдин — редкий случай, когда основа почти наверняка тюркская, а суффикс — русский, что сразу указывает на регион и историю появления. В русской ономастике фамилии на -дин встречаются нечасто; обычно это адаптация тюркских или финно-угорских имен и прозвищ, где конечное -дин — не суффикс, а часть корня. Но здесь -ин — стандартный русский притяжательный суффикс (чей? — Айгельдин), присоединённый к основе «Айгельд». Такой способ словообразования типичен для фамилий, возникших у крещёных тюркских народов Поволжья и Приуралья, особенно у татар и башкир, в XVIII–XIX веках.

Основа «Айгельд» восходит к тюркскому двусоставному имени Айгильде или Айгельды. Первая часть — ай («луна», «месяц») — распространённый компонент в тюркских именах, несущий значение красоты, света, божественного начала. Вторая часть — гильде (от глагола кил- — «пришёл», «явился») — означает «пришёл», «родился». В целом имя переводится как «луна пришла» или «родился в полнолуние» — типичная формула, которой желали ребёнку светлой судьбы. В татарском и башкирском именнике такие конструкции (Айгильде, Айдар, Айсылу) — одни из древнейших.

Фамилия Айгельдин, скорее всего, образована от имени отца — Айгельда (Айгильды). В русской среде имя записали на слух: конечное -ы отпало или перешло в -а, и добавили суффикс -ин. Вариант с буквой е (Айгельдин вместо Айгильдин) — результат адаптации к русской графике, где е после гласного читается как [йэ] и звучит ближе к тюркскому произношению.

Носители фамилии исторически концентрируются в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской и Челябинской областях — именно там фиксируются метрические записи XVIII–XIX веков с этой фамилией. Сословно предки могли быть государственными крестьянами, тептярями или башкирами-вотчинниками, принявшими православие (фамилия не обязательно мусульманская — -ин выдают христианскую традицию оформления). Встречается и вариант Айгильдин — он точнее передаёт оригинальное имя, но менее распространён в современных документах.

С точки зрения словарей, фамилия не попала в классические справочники Б. Унбегауна и В. Никонова — слишком редкая и локальная. Но её разбор однозначен: это типичная «отцовская» фамилия тюркского происхождения, закрепившаяся на стыке двух языковых миров.