Фамилия Айгильдин — одна из тех, что сразу выдают тюркские корни, причем довольно древние. В её основе лежит сложное имя Айгильды (Айгильде), которое состоит из двух частей: «ай» (луна) и «гильды» (пришёл, прибыл). В буквальном переводе с татарского или башкирского это означает «луна пришла» или «родившийся в новолуние». Такие «лунные» имена были распространены у тюркских народов, особенно в среде башкир и татар, где новорождённого могли назвать в честь фазы луны, месяца или времени суток. Айгильдин — это русифицированная форма отчества: сын Айгильды, то есть «Айгильдин сын». Суффикс -ин указывает на принадлежность, как в фамилиях Кузьмин или Ильин, но в данном случае основа не славянская, а заимствованная.

Интересно, что фамилия Айгильдин встречается не повсеместно, а имеет заметную географическую привязку. По данным переписей и телефонных справочников, наибольшая концентрация носителей фиксируется в Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях — то есть в зоне исторического расселения башкир и татар. Это не случайно: фамилия образовывалась уже после присоединения региона к России, когда местное население стало получать русские по форме, но тюркские по содержанию фамилии. В этом смысле Айгильдин — типичный пример «русской фамилии на тюркской основе», которых в Поволжье и на Урале тысячи.

С точки зрения словообразовательной модели, фамилия стоит в ряду таких же сложных именных фамилий, как Уразгильдин (от «ураз» — счастье + «гильды»), Бикмурзин или Кульмухаметов. Суффикс -ин здесь работает без вариантов -ов, что тоже показательно: в русском языке фамилии на -ин чаще образовывались от основ на -а, -я, и имя Айгильды (Айгильда) идеально подходит под эту модель. Иногда встречается вариант написания Айгильдеев, но он гораздо реже и, скорее всего, является позднейшим искажением или попыткой «обрусить» фамилию по образцу на -ев.

В дореволюционных документах фамилия могла записываться по-разному: Айгильдин, Айгильдинов, а то и Айгильдеев — из-за нестабильности русской передачи тюркских звуков. Однако современный стандарт закрепил форму Айгильдин. Социальный состав носителей был пёстрым: среди предков могли быть и рядовые крестьяне-башкиры, и служилые татары, и даже мелкие торговцы. Дворянских корней у фамилии нет — она из народной среды, что только подчёркивает её прямую связь с именем-прозвищем, данным при рождении.