Фамилия Айгубова — женская форма фамилии Айгубов, и её происхождение уходит корнями в арабский и тюркский мир. В основе лежит мужское имя Айгуб, вариант имени Аюб (арабская форма библейского Иова). В исламской традиции пророк Аюб известен как образец терпения и стойкости в вере. Имя Аюб, а затем и его форма Айгуб, было широко распространено среди народов, исповедующих ислам, особенно в тюркоязычной среде — у татар, башкир, кумыков, азербайджанцев и народов Кавказа.

Словообразовательная модель проста: к имени Айгуб добавили русский патронимический суффикс -ов. Этот суффикс указывает на принадлежность: «Айгубов» буквально означает «сын Айгуба», а Айгубова — «дочь (или жена) Айгуба». Такая модель типична для фамилий, которые возникли у народов Поволжья, Северного Кавказа и Средней Азии в XIX–XX веках, когда русская административная система фиксировала родовые прозвания по отцу.

Географически фамилия Айгубова чаще всего встречается в регионах с тюркским и кавказским населением: в Дагестане, Чечне, Татарстане, Башкортостане, а также среди азербайджанцев. Встречается она и у ногайцев. Сословного барьера у фамилии не было: её могли носить и крестьяне, и духовные лица, и военные, поскольку имя Аюб (Айгуб) было общеупотребительным.

Любопытная деталь: в некоторых тюркских языках имя Айгуб могли переосмыслять как «лунный» (от «ай» — луна), но это народная этимология. Научная версия — через пророка Аюба — считается основной, так как она подтверждается историей исламской антропонимии. Таким образом, фамилия Айгубова отсылает не к луне или месяцу, а к древней истории терпения и веры, закреплённой в имени.