Фамилия Айко — редкий пример, когда географический след ведёт не вглубь России, а на Кавказ или в Причерноморье. Носители этой фамилии чаще всего встречаются в Абхазии, среди армян и грузин, а также у народов Северного Кавказа. В русском контексте она воспринимается как иноязычное заимствование, не вписывающееся в привычные модели с суффиксами -ов или -ин.

Основа фамилии — личное имя Айк. У армян это краткая форма от Айкануш или Айкас, но чаще всего — самостоятельное имя, восходящее к имени легендарного прародителя армян Айка (Հայկ). По преданию, Айк — богатырь и стрелок из лука, победивший тирана Бела. Фамилия Айко, таким образом, буквально означает «потомок Айка» или «принадлежащий Айку». В грузинской среде такое окончание на -о типично для фамилий (ср. Андро, Вано, Гио) и указывает на мужское имя в основе.

Иногда фамилию Айко путают с финской фамилией Aiko, но это разные корни: финское Aiko происходит от слова «время» (aika) и не имеет отношения к кавказскому антропониму. Для русской ономастики фамилия Айко — экзотизм, который принесли в метрики переселенцы или беженцы XIX–XX веков. Встречается также вариант Айков — результат русификации: к основе Айк добавили типичный русский суффикс принадлежности.

По сословному происхождению предки Айко могли быть как крестьянами, так и княжеского рода — в Армении и Грузии фамилии на -о не указывают на социальный статус, в отличие от русских окончаний. Если искать однокоренные фамилии, то ближе всего Айкян (армянская модель с суффиксом -ян) и Айкаев (адаптация через русский суффикс). В любом случае, носитель фамилии Айко почти наверняка имеет корни в Закавказье, а его фамилия — это память о древнем имени, которое старше многих европейских династий.