Фамилия Айко — редкий случай, когда географический след ведёт не вглубь России, а на Кавказ или в Причерноморье. Носители этой фамилии чаще всего встречаются в Абхазии, среди армян и грузин, а также у народов Северного Кавказа. В русском контексте она воспринимается как иноязычное заимствование, не вписывающееся в привычные модели с суффиксами -ов или -ин.

В основе фамилии лежит личное имя Айк. У армян это самостоятельное имя, восходящее к легендарному прародителю Айку (Հայк) — богатырю и стрелку из лука, победившему тирана Бела. Реже Айк выступает как краткая форма от Айкануш или Айкас. Фамилия Айко буквально означает «потомок Айка» или «принадлежащий Айку». Окончание на -о здесь — не случайность, а типичная грузинская модель образования фамилий (сравните Андро, Вано, Гио), где суффикс указывает на мужское имя в основе без дополнительных притяжательных формантов.

Иногда фамилию Айко путают с финской Aiko, но это разные корни: финское слово aika означает «время» и не имеет отношения к кавказскому антропониму. Для русской ономастики фамилия Айко — экзотизм, который принесли в метрики переселенцы или беженцы XIX–XX веков. Встречается также русифицированный вариант Айков: к основе Айк добавили типичный русский суффикс принадлежности, подгоняя фамилию под привычное звучание.

По сословному происхождению предки Айко могли быть как крестьянами, так и княжеского рода — в Армении и Грузии фамилии на -о не указывают на социальный статус, в отличие от русских окончаний. Если искать однокоренные фамилии, ближе всего Айкян (армянская модель с суффиксом -ян) и Айкаев (адаптация через русский суффикс). Носитель фамилии Айко почти наверняка имеет корни в Закавказье, а его фамилия хранит память об имени, которое старше многих европейских династий.