Фамилия Аймаханова — одна из тех, для понимания которых нужно обращаться не к славянскому, а к тюркскому материалу. Она явно образована от мужского имени Аймахан по русской патронимической модели с суффиксом -ов, который в женском варианте даёт окончание -а. Основа здесь — сложное имя, типичное для тюрко-монгольского мира, где «ай» означает «луна», а «хан» — титул верховного правителя, князя или военачальника. Таким образом, имя Аймахан можно перевести как «лунный хан» или «хан луны» — не буквально, а как пожелание носителю быть светлым, ясным, благородным, подобно луне.

Мужская форма — Аймаханов. Такие фамилии на -ов/ев и -ин у народов Поволжья, Урала, Казахстана и Средней Азии возникали в XIX–XX веках, когда русская администрация фиксировала местное население по отчеству. Аймаханова — это буквально «дочь или жена Аймахана». Судя по структуре, предок носителя фамилии был человеком, которого звали Аймахан, и он, скорее всего, принадлежал к тюркоязычной среде: татарам, башкирам, казахам или ногайцам. Встречаемость фамилии невысока, она сконцентрирована в регионах с сильным татарским или казахским населением — например, в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области, а также в Казахстане.

Словообразовательный суффикс -ов здесь не несёт сословной нагрузки: по этой модели получали фамилии и крестьяне, и купцы, и военные. В отличие от фамилий на -ский, которые чаще встречались у дворян и духовенства, Аймаханова — типичная «народная» фамилия, возникшая в среде, где отчество переходило в родовое имя. Единственная деталь, которая выделяет её среди сотен тюркских фамилий на -ов, — это редкое и поэтичное имя в основе. «Аймахан» не такое частое, как, скажем, Ахмет или Ибрагим, что может указывать на конкретный род или локальную традицию именования.