Фамилия Аймаганов — редкий случай, когда в основе лежит не прозвище или профессия, а географическое название, и притом тюркское. Если разобрать её по составу, мы видим корень «Аймаган» и русский патронимический суффикс «-ов», который буквально означает «сын Аймагана» или «потомок Аймагана». Само слово «Аймаган» — это, скорее всего, этноним или топоним, адаптированный под личное имя.

Вероятнее всего, в основе лежит слово «аймак» — так у тюркских и монгольских народов называют крупное племенное объединение или административную область (например, аймаки в Бурятии, Монголии, у алтайцев). Форма «Аймаган» могла возникнуть как притяжательное прилагательное или имя, данное человеку из этого аймака. В казахском и башкирском языках есть личное имя Аймаган, образованное от «ай» (луна) и «маган» (мне, для меня) — то есть «луна для меня» или «мой месяц». Однако в качестве фамильной основы более логично выглядит первая версия: предок Аймагановых был выходцем из конкретного аймака или носил родовое прозвище по месту жительства. Имя Аймаган с «лунным» значением — скорее поэтический антропоним, а фамилия, по правилам народной ономастики, чаще цеплялась за реальную привязку к территории, чем за лирику.

С точки зрения географии, фамилия отчетливо тяготеет к Казахстану и южным регионам России (Оренбуржье, Астраханская область), а также к Башкортостану. Встречается она и у татар. Это говорит о том, что фамилия сформировалась в среде, где русская модель образования фамилий на «-ов» наложилась на тюркскую ономастику. Суффикс «-ов» здесь не случайность: он показывает, что носители фамилии либо перешли в русское подданство, либо жили в смешанной этнической среде, где патроним оформляли по русскому образцу. В сословном плане Аймагановы, скорее всего, были не из знати, а из крестьян или казаков. Аймачная система у кочевников не предполагала наследственных дворянских титулов, поэтому фамилия — типичный пример «народной» ономастики, где человека называли по его родовой территории.

Если сравнивать с однокоренными, то Айманов или Аймаков — более распространенные варианты, а Аймаганов — редкая форма с дополнительным суффиксальным наращением. Это делает её особенно ценной для генеалогии: она точнее указывает на конкретное лицо, а не на весь род. В документах XVII–XVIII веков такие «длинные» формы часто возникали, когда нужно было отличить одного человека от другого внутри большого аймака — например, Аймаган, а не просто Аймак. Так что фамилия не только редкая, но и необычайно информативная: по ней можно восстановить и этническую среду предков, и их социальный статус, и даже примерный маршрут миграции.