Фамилия Аймаганбетов происходит от сложного тюркского мужского имени Аймаганбет. В этой модели словообразования суффикс -ов указывает на принадлежность: Аймаганбетов буквально значит «сын Аймаганбета» или «потомок Аймаганбета». Само имя составное, и его разбор даёт ключ к пониманию смысла фамилии.

Первая часть, Ай, восходит к арабскому слову со значением «счастливый». Вторая часть — Маганбет, диалектный вариант имени Мухаммад, которое переводится как «прославляемый», «восхваляемый». Таким образом, имя Аймаганбет можно истолковать как «счастливый Мухаммад» или «прославляемый счастьем». Это типичная для тюркской ономастики модель, где к сакральному или уважаемому имени (в данном случае пророка Мухаммада) добавляют благопожелательный эпитет.

Словообразовательный суффикс -ов, а не тюркские -улы/-кызы, указывает на то, что фамилия оформлялась уже в русской административной среде, скорее всего, во время переписей или при документальном закреплении фамилий в XIX–XX веках. Географически фамилия Аймаганбетов распространена прежде всего среди казахов, реже встречается у других тюркских народов. Предок носителя этой фамилии, вероятно, был человеком, получившим при рождении составное имя с религиозным и пожелательным оттенком, что говорит о традиционной мусульманской среде и уважении к имени пророка в его диалектной форме.