Фамилия Алимаганбетов образована от имени Алимаганбет. Оно состоит из двух компонентов: Али - «высокообразованный, обладающий большими знаниями, ученый», «всезнающий, всеведающий» и Маганбет, которое является производной формой мусульманского мужского имени Мухаммед. В переводе с арабского языка имя Мухаммед означает «восхваляемый, прославляемый». Таким образом, имя Алимаганбет дали ребенку в честь пророка Мухаммеда и первого халифа Али. Таким образом, потомок человека, которого звали Алимаганбет, со временем получил фамилию Алимаганбетов.