Фамилия Айсандырова — редкий случай в русском ономастиконе. Ее основа явно не славянская, и чтобы понять происхождение, нужно смотреть в сторону тюркских языков. Скорее всего, в основе лежит мужское имя Айсандыр (или Айсандыр). Оно составное: первая часть «ай» переводится как «луна», вторая — «сандыр» — может восходить к глаголу со значением «ломать», «разрушать» или к имени Сандыр, которое, в свою очередь, является тюркской формой имени Александр. Если принять вторую версию, то имя Айсандыр означает «Лунный Александр» или «Подобный луне Александр» — красивое, поэтичное имя, где славянский (греческий) компонент переплетается с тюркским.

Фамилия образована по русской модели: к основе Айсандыр добавили суффикс -ов, а затем женское окончание -а. Типичная картина для народов Поволжья, Урала или Кавказа, где в XIX–XX веках, при переходе на русское делопроизводство, тюркские имена и прозвища получали русские фамильные суффиксы. Носительница фамилии Айсандырова, скорее всего, имеет корни в среде башкир, татар, казахов или ногайцев. Мужская форма — Айсандыров — указывает на то, что предок по мужской линии носил имя Айсандыр или прозвище, от него образованное.

Суффикс -ырова в этой фамилии — не опечатка. В русском языке при добавлении -ов к основе на -ир (Айсандыр) на письме часто сохраняется твердый ы, а не мягкий и. Это орфографическая особенность, а не признак другого суффикса. Фамилия не дворянская и не старинная — она массово появилась не раньше середины XIX века, когда у тюркских народов начали фиксировать фамилии по отчеству. Сейчас фамилия встречается в Башкортостане, Татарстане и Оренбургской области — именно там, где пересекались тюркские и русские традиции имянаречения.