Фамилия Айтхожаев — типичный пример фамилии, образованной от личного имени. Её основа — мужское имя Айтхожа, которое в тюркской и персидской среде сложилось из двух компонентов. Первый, тюркский «айт», означает «праздник». Второй — персидское «хожа» (хозяин, господин, наставник), близкое по смыслу к арабскому «хаджи». Хаджи — это почётный титул мусульманина, совершившего хадж в Мекку. Со временем это слово перешло в разряд личных имён, и имя Хожа стало самостоятельным.

Соединившись, части имени дают прозрачную картину: родители назвали сына Айтхожа, желая ему благочестивой жизни и, возможно, будущего паломничества. А компонент «айт» указывает на то, что мальчик родился в день крупного мусульманского праздника — например, Курбан-айта или Ураза-айта. Таким образом, имя фиксировало и дату рождения, и религиозное пожелание.

Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ев, который присоединяется к основам на мягкий согласный или на -а/-я. В данном случае к имени Айтхожа добавили -ев, и получилось Айтхожаев — «сын Айтхожи». Такая модель характерна для фамилий многих народов, живших в контакте с русской административной и церковной традицией.

Фамилия распространена в среде казахов, откуда она, скорее всего, и происходит. Встречается также у татар, башкир и других тюркоязычных народов. Среди носителей фамилии есть люди разных профессий, но исторически предки Айтхожаевых могли быть либо религиозными деятелями (муллами, учителями), либо просто крестьянами или скотоводами, получившими фамилию по имени основателя рода.