Фамилия Бабугоев — типичный пример кавказской модели, где родовое имя берёт начало от названия местности или тейпа. Такие фамилии подчёркивали, из какого рода и с какой земли человек родом. Но в случае с Бабугоевыми исходное прозвище Бабугой имеет не столько географическую, сколько прозвищную или даже охранительную природу.

Самая прямая версия связывает основу «бабугой» с кабардинскими словами «баббакъ» или «бабуш» — «селезень», «утка». Скорее всего, прозвище закрепилось за человеком, который промышлял охотой на водоплавающую птицу. Но в старину на Кавказе, как и у многих народов, были распространены личные имена, образованные от названий животных и птиц — такие имена давали детям как обереги или просто по народной традиции. Так что Бабугой могло быть и именем, а не только прозвищем.

Есть и другая, менее известная версия. В кавказском быту «бабуком» называли вдовца, который после смерти жены больше не женился. Если это так, то прозвище отражало не занятие, а семейное положение основателя рода. Обе версии не противоречат друг другу: разные ветви одного рода могли получить прозвище по разным причинам, а фамилия закрепилась за всеми.

Документы начала XX века подтверждают бытование фамилии среди кабардинцев. В записях встречаются Бабугоев Бороко Герандукович (1867 года рождения, село Аргудан) и Бабугоев Газиз Увжукович (1909 года рождения). Оба — кабардинцы. Это указывает на устойчивую родовую традицию в центральной части Кабарды. Фамилия не получила широкого распространения за пределами региона и остаётся локальной, что только подчёркивает её связь с конкретным тейпом и местностью.