Фамилия Багликова — отчество по прозвищу или имени отца. В её основе лежит слово «баглик», а вот что оно значило — вопрос, на который у исследователей нет единого ответа. Самая убедительная версия связывает фамилию с курскими говорами, где «баглай» — лентяй, дармоед, увалень. Если это так, то прозвище Баглик дали человеку нерадивому или медлительному, а его дети и внуки стали Багликовыми. Суффикс -ов- указывает на типичную русскую модель образования: «чей?» — «Багликов», то есть сын или потомок Баглика.

Менее вероятна, но тоже встречается в ономастике версия об арабском имени Баглан («ягнёнок»). Уменьшительная форма Баглик могла попасть в русскую среду через татар или другие тюркские народы, но для фамилии, бытующей в центральной России, это скорее экзотика, чем правило. Слабость гипотезы в том, что нет устойчивой традиции превращать арабское «Баглан» именно в «Баглик» на русской почве, а диалектное «баглай» документально зафиксировано.

Фамилия редкая, в списках массовых не значится. Её географическое распространение — вероятнее всего, южнорусские области, где слово «баглай» было в ходу. В написании обращает на себя внимание суффикс -ик-: он мог появиться как вариант прозвища (Баглик вместо Баглай) или как следствие акающего произношения, когда безударное «а» перешло в «и». Как бы то ни было, фамилия Багликова хранит память о прозвище, а не о крестильном имени, и в этом её отличие от большинства русских фамилий на -ов.