Фамилия Багликов — это типичный пример русской фамилии, образованной от прозвища. В её основе лежит прозвище Баглик, которое, скорее всего, связано с диалектным словом «баглай». В курских говорах так называли лентяя, дармоеда или увальня. Прямого отношения к современному литературному языку это слово не имеет, но в прошлом было вполне употребительно в народной среде. Суффикс -ов в фамилии указывает на принадлежность: Багликов буквально означает «сын Баглика» или «потомок Баглика».

Менее распространённая версия возводит прозвище к арабскому имени Баглан («ягнёнок»), от которого будто бы образовали уменьшительно-ласкательную форму Баглик. Однако эта гипотеза слабее: в русской ономастике гораздо больше примеров, когда фамилии возникали из местных прозвищ, а не из заимствованных имён, не получивших широкого хождения в крестьянской среде. К тому же диалектное «баглай» хорошо вписывается в модель прозвищ, даваемых по поведению или характеру, — таких, как Лентяев, Гуляев или Лежебоков.

Фамилия Багликов встречается нечасто, что тоже говорит в пользу её локального происхождения: она могла закрепиться в конкретной местности, где слово «баглай» было в ходу. Скорее всего, предок носителя фамилии получил это прозвище за нерасторопность или склонность к праздности — не обязательно как оскорбление, а как бытовую характеристику, которая со временем стала родовым именем.