Фамилия Бакарягина — женская форма фамилии Бакарягин. Её основа — прозвище Бакаряга, которое, скорее всего, связано с торговлей и ремеслом. В русских говорах «бакаряга» или «бакаря» — это мелкий торговец, разносчик, коробейник. Таких людей называли также «бакалейщиками» (от «бакалея» — мелкий сухой товар). Таким образом, предок носительницы фамилии мог заниматься развозной или лавочной торговлей, быть офеней или прасолом.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Бакарягин — сын или потомок Бакаряги. Такая модель типична для прозвищ на -а/-я (Бакаряга → Бакарягин). Ударение в исходном прозвище, скорее всего, падало на последний слог (Бакаря́га), что характерно для некоторых волжских и северных говоров.

Версия о происхождении от тюркского «бакыр» (медь) или «бакыржы» (медник) менее вероятна: фонетика фамилии (особенно мягкое «р» и окончание -яга) выдает славянскую, а не тюркскую словообразовательную модель. Формант -яга — характерный для севернорусских и сибирских говоров суффикс, придающий прозвищу оттенок пренебрежительности или, наоборот, фамильярности (ср. Ветряга, Ширяга, Бродяга).

Фамилия редкая. Географически может быть связана с регионами, где было развито отходничество и мелкая торговля: Поволжье, Вятка, Урал, Сибирь. Встречается и вариант написания Бакарягин с одной «г» — это следствие упрощения в произношении, а не отдельная фамилия.