Фамилия Бакалягины — одна из тех, чья основа уходит в торговые и межкультурные связи. Её ядро — прозвище Бакаляга. Большинство исследователей сходится на том, что оно восходит к арабскому слову «баккал» — «продавец съестных припасов». Через турецкий это слово перешло в болгарский (где «бакал» значит просто «торговец едой»), а оттуда — в языки народов России. Именно этот корень мы сегодня узнаём в слове «бакалея» — продуктовый отдел. Значит, предок Бакалягиных мог держать лавку, торговать крупами, мукой и прочими припасами.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: «чей сын?» — Бакалягин. Такая модель в русских фамилиях очень распространена, но здесь она работает с прозвищем, а не с крестильным именем. Это говорит о том, что прозвище было устойчивым и передавалось в семье.

Есть и другая версия, локальная. На Урале «бакалом» называли мусульманина, принявшего православие. Если предок Бакалягиных родом оттуда, прозвище могло закрепиться за ним как раз по этому признаку. Эта версия менее вероятна, но её стоит упомянуть: географическая привязка к Уралу может сузить круг поисков для тех, кто изучает свою родословную.

Фамилия довольно редкая. В отличие от массовых Бакаловых или Бакаевых, форма с суффиксом «-яг-» и окончанием «-ин» встречается реже, что делает её более локальной и, возможно, указывает на конкретную ветвь рода. О точном времени возникновения говорить сложно — процесс формирования русских фамилий шёл несколько столетий, но ясно, что перед нами не дворянская фамилия, а скорее купеческая или крестьянская, образованная от живого прозвища.