Фамилия Бакбергенов — характерный пример фамилии, образованной от составного арабо-тюркского личного имени. Её основа отчётливо распадается на две части: «бак» (или «бек») и «берген». Первый корень восходит к тюркскому «бек» или «бай» — титул знати, господин, князь, позже просто уважаемый, состоятельный человек. Вторая часть — «берген» — причастие от глагола «бер» (давать) в тюркских языках, то есть «давший», «подаривший». Вместе имя Бакберген (или Бекберген) означает «богом данный», «дарованный господином» или, в более религиозном контексте, «данный Всевышним».

Фамилию эту стоит рассматривать в ряду других фамилий на -ов, образованных от тюркских имён с компонентом «берген»: Бергенов, Кулбергенов, Аллабергенов. Суффикс -ов — классический русский патронимический формант, который в XIX—XX веках массово присоединяли к нехристианским именам при русификации фамилий в среде казахов, татар, башкир и других народов региона. Таким образом, Бакбергенов — это буквально «сын Бакбергена», то есть потомок человека, носившего это имя.

Географически фамилия Бакбергенов наиболее типична для Казахстана, особенно для западных и южных областей, а также встречается среди каракалпаков и отчасти у башкир. Встречаются и варианты написания: Бекбергенов, Бакберген, Бекберген — они отражают диалектные особенности произношения (чередование «а» и «е» в первом слоге). В русских документах фамилия закрепилась именно в форме Бакбергенов, так как через «а» она точнее передаёт звучание в некоторых тюркских говорах.

Сословно носители фамилии относились к числу свободных общинников, реже — к потомкам старшин или биев. Никакого специфического ремесла или занятия имя не обозначало: его давали ребёнку как благопожелание, прося у высших сил удачи и покровительства. Поэтому предки Бакбергеновых могли быть и скотоводами, и земледельцами, и воинами — имя не накладывало профессионального отпечатка.

Известных носителей фамилии, вошедших в общероссийские энциклопедии, немного, что типично для фамилий, распространённых преимущественно в одном регионе. Однако по казахстанским базам данных можно встретить Бакбергеновых — учёных, спортсменов, деятелей культуры, что подтверждает её живую историю и не угасшую до сих пор употребительность.