Фамилия Бахабаев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Бахабаев уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Бахабаев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Бахабаев образована от мужского тюркского имени Бахабай. Первая из них восходит к имени Баха, которое в переводе на русский язык означает «прекрасный, красивый». Таким образом, буквально имя Бахабай означает «прекрасный господин». Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Бахабаев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Бахабаев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.