Фамилия Бахенская — классический пример образования от географического названия с помощью суффикса -ск-, указывающего на принадлежность к месту. В русской ономастике такие фамилии чаще всего получали дворяне по названию родового поместья или выходцы из определённой местности. Основа здесь — топоним Бахенка, Бахеново или Бахены. Такие названия встречаются в разных регионах, но особенно характерны для запада России, Украины и Беларуси, где распространены сёла с корнем «бах-».

Корень «бах» в славянских говорах многозначен. В южнорусских и украинских диалектах «бах» — это звукоподражание удару или выстрелу, отсюда прозвище Бахеня могли дать громкому, шумному человеку или тому, кто работал с порохом (пушкарю, охотнику). В польском языке «bach» означает «мальчик», «парень», а «bachnąć» — «грохнуть», «шлёпнуть». Поэтому фамилия Бахенская могла возникнуть и на пограничных с Польшей территориях, где смешивались языковые традиции.

Мужской вариант — Бахенский. Встречается он реже, чем женская форма, которая закрепилась в документах, вероятно, по линии матери или вдовы. Типичная модель: помещик владел деревней Бахенка, его потомки получали фамилию по названию усадьбы. Если же предок был не дворянином, а крестьянином, переселившимся из села Бахены, фамилию ему давали по месту выхода — так называемые «географические» фамилии простого сословия.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Бахарев, Бахтин, Бахов — показывает, что суффикс -ск- отличает Бахенских как более позднюю или книжную форму. В то время как Бахаревы или Баховы образованы напрямую от прозвища, Бахенская несёт отпечаток официального закрепления за территорией. В дореволюционных метрических книгах фамилия чаще встречается в Волынской, Минской и Смоленской губерниях, что подтверждает её западнорусское происхождение.

Точных данных о первом носителе нет, но логика подсказывает: предок Бахенских жил в месте с названием вроде Бахенка, где «бах» могло означать и «болото» (в некоторых говорах), и «грохот». Фамилия не из самых частых, но и не единичная — её обладатели встречаются сегодня в России, Украине и Беларуси, сохраняя связь с топонимом, который уже мог исчезнуть с карты.