Фамилия Бахолдин ведет происхождение от прозвища Бахолда, за которым стоит диалектное слово с разными, порой противоположными, оттенками смысла. В Тамбовской и Тульской губерниях «бахолдой» называли человека ленивого и вялого, в Приуралье — хвастуна и лгуна, а в черноземной полосе — болтуна. Такая географическая пестрота значений не редкость для русских прозвищ: одно и то же слово в разных местностях могло характеризовать и медлительного, и неискреннего, и словоохотливого человека.

Прозвище, скорее всего, отражало заметную черту характера основателя рода. Был ли он нерасторопен, хвастлив или просто общителен — теперь не установить, но именно это слово закрепилось за ним и перешло к потомкам. Форма Бахолдин образована по стандартной патронимической модели: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть буквально «сын Бахолды».

Фамилия редкая, и её география подсказывает, что корни семьи стоит искать в центральных и восточных регионах России — на Тамбовщине, Туле, в Приуралье. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто образовывали от имен на согласный, суффикс -ин здесь закономерен, так как основа оканчивается на -а. Встречается написание через «о» (Бахолдин), что соответствует произношению и закрепилось в документах.