Фамилия Бахшикулов — один из тех случаев, где разбор начинается не с корня, а с необычного форманта. В ней отчетливо выделяются три части: основа «Бахши», суффикс «-кул» и окончание «-ов». Такая модель нетипична для великорусских фамилий, где суффикс «-ов» обычно крепится прямо к основе, а не к другому суффиксу. Второй компонент «-кул» — прямой намек на тюркское происхождение. В татарском, башкирском, казахском и других тюркских языках «кул» означает «раб» или «слуга», но в антропонимике это слово приобрело значение «раб божий», «слуга всевышнего». Имена с таким компонентом (Кулмухаммет, Кулбай, Кулбахши) были распространены в среде мусульман Поволжья, Средней Азии и Кавказа.

Основа «Бахши» восходит к слову «бахши» (или «бакши»). В тюркских языках у этого слова несколько значений: учитель, писец, народный певец-сказитель (как в туркменской и узбекской традициях), а также — в историческом контексте — буддийский монах или жрец. В русских документах XVI–XVII веков «бахши» упоминаются как толмачи и переводчики, особенно в отношениях с восточными посольствами. Таким образом, Бахшикул — это составное личное имя, которое можно перевести как «слуга наставника» или «слуга певца». Впрочем, первая часть могла быть и собственным именем Бахши, то есть имя означало «раб (божий) по имени Бахши».

Регионально фамилия тяготеет к Волго-Уральскому региону, особенно к татарской и башкирской среде. Встречается она и у казахов, но реже. Судя по суффиксу «-ов», фамилия прошла русификацию: в тюркской среде она звучала бы как Бахшикулов (без окончания) или Бахшикулы. Её носители, скорее всего, происходят из сословия служилых татар или башкир, которые в XVII–XIX веках получали фамилии по отцу, записывая их по русскому образцу. Спорных версий здесь немного: попытки связать «бахши» с санскритским «бхикшу» (монах) или персидским «бахш» (доля, часть) выглядят натянутыми, так как прямое тюркское бытование слова хорошо задокументировано.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Бахшиев, Бахшинов, Бахшибаев — показывает, что Бахшикулов стоит особняком именно из-за редкого форманта «-кул». В русском ономастиконе фамилий с таким суффиксом немного, и почти все они указывают на тюркские корни носителей.