Фамилия Бакитько — яркий пример украинской модели фамилий на -ко, которая в XVII–XVIII веках стала одной из самых продуктивных на Левобережной и Правобережной Украине. Суффикс -ко в украинской ономастике выполнял уменьшительно-ласкательную или патронимическую функцию: он превращал личное имя или прозвище в фамилию, указывая на потомка («чей-то сын» или «маленький, младший»). В случае Бакитько основа — Бакит(а) — скорее всего, восходит к прозвищу, образованному от глагола «бакити» (украинское «бачити» — видеть, замечать). В диалектах слово «бакит» могло означать «зоркий глаз» или «наблюдательного человека», а также «тот, кто видит далеко» или даже «прорицатель». Таким образом, первый носитель прозвища Бакита был, вероятно, человеком с острым зрением или особым чутьём.

Встречается и менее распространённая версия, связывающая фамилию с тюркскими корнями: слово «бакыт» в ряде тюркских языков означает «счастье, удача». Однако для украинской фамилии это объяснение менее правдоподобно, так как суффикс -ик(о) типичен именно для славянских прозвищных основ. Скорее всего, Бакитько — это «сын Бакиты», где Бакита — прозвище, закрепившееся за родоначальником.

Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины, особенно к Полтавщине и Черкащине, где фамилии на -ко встречаются особенно часто. В России она редка и, как правило, принадлежит потомкам переселенцев с Украины. Социально фамилия не несёт следов дворянского происхождения — её носителями были казаки, мещане или крестьяне, которым прозвище давалось по личным качествам, а не по сословной принадлежности. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые в России часто указывали на владельца крепостного, Бакитько — пример именования «снизу», от уличного прозвища, которое закрепилось за родом.