Фамилия Баклунова — женская форма фамилии Баклунов, и её происхождение связано с одним из самых узнаваемых русских фразеологизмов. Основа фамилии — слово «баклуша», но не стоит спешить с выводами: значение «бить баклуши» (то есть бездельничать) — вторичное, а прозвище Баклуша могло иметь совсем другой, даже уважительный смысл.

В ремесленной среде баклушами называли заготовки для деревянных ложек и другой мелкой утвари. Расколоть чурбан на баклуши считалось простой, черновой работой, которую поручали подмастерьям или ученикам. Отсюда и пошло выражение «бить баклуши» — делать лёгкое, не требующее мастерства дело, которое со временем стало символом праздности. Однако прозвище Баклуша могли дать не лентяю, а, наоборот, ремесленнику, который эти самые баклуши изготавливал — токарю или ложкарю. В северных и волжских губерниях, где процветал ложкарный промысел (Нижегородская, Вятская, Владимирская губернии), фамилии на -ов от таких прозвищ были особенно часты.

Суффикс -ов в основе Баклунов указывает на типичную русскую патронимическую модель: Баклунов — сын Баклуши. Это одна из самых распространённых моделей для фамилий, образованных от прозвищ, оканчивающихся на твёрдый согласный. Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с некалендарным именем Баклуша, которое могло быть охранительным — чтобы ребёнок рос не ленивым, а работящим, его нарекали «ленивым» именем, обманывая злых духов.

Географически фамилия Баклунов и её женская форма Баклунова в основном встречаются в областях традиционного ложкарного промысла: в Нижегородской области, в Поволжье, а также на Урале, куда ремесленники переселялись в XVIII–XIX веках. Среди однокоренных фамилий — Баклушин, Баклушев, Бакланов (хотя у последнего может быть иная основа — от птицы баклан). В отличие от фамилии Бакланов, которая часто ассоциируется с казачеством и югом России, Баклунова — более северная, «ремесленная» фамилия, прямо указывающая на занятие предка.