Фамилия Баклунин — один из тех случаев, когда исходное слово на слуху у каждого, но его фамильное значение неочевидно. Основа здесь — «баклуша», и первая ассоциация с поговоркой «бить баклуши» не случайна, хотя и требует уточнения.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Баклунин — это «чей?» — сын или потомок Баклуни. А Баклуня — это либо прозвище, либо разговорная форма имени (например, от Вакх или Баклан). Но самая вероятная версия лежит в ремесленной плоскости. Баклуша — это заготовка для деревянной ложки или чашки: чурка, которую «били» (раскалывали) на болванки. Прозвище Баклуня могли дать тому, кто изготавливал такие заготовки — баклушнику. Работа считалась простой и неквалифицированной, отсюда и пошло выражение «бить баклуши» — заниматься пустяковым делом. Однако в крестьянском быту это было самое настоящее, хоть и подсобное, ремесло, кормившее целые деревни.

Слово «баклуша» имеет и другое значение — так в некоторых говорах называли небольшую льдину или лужицу. В этом случае прозвище Баклуня могло достаться человеку невысокому, щуплому или, наоборот, скользкому и увертливому. Но ремесленная версия выглядит убедительнее, поскольку фамилии от названий профессий — массовое явление, а метафора «льдина» встречается реже.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным губерниям России, где было развито деревянное производство: Архангельская, Вологодская, Нижегородская области. Встречаются однокоренные варианты — Баклушин, Баклушев, Бакланов, но Баклунин выделяется именно архаичным суффиксом принадлежности, что может говорить о более раннем закреплении прозвища в качестве фамилии.

Таким образом, предок носителя фамилии Баклунин с высокой долей вероятности был мастеровым человеком, чья работа начиналась с простого, но необходимого дела — заготовки деревянных чурок для ложек и плошек. Прозвище закрепилось за ним или за его детьми, и со временем превратилось в фамилию, сохранившую память о незатейливом, но честном труде.