Фамилия Бакнин — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять, откуда она взялась, нужно разобрать её по составу. Основа здесь — «Бакн-», а суффикс «-ин» указывает на принадлежность: «чей?» — Бакнина. В русской традиции так образовывали фамилии от прозвищ или мирских имён отца.

Скорее всего, в основе лежит прозвище или неканоническое имя Бакня. Как оно возникло? Самая правдоподобная версия связана с диалектным словом «бака» или «бакуня» — так в некоторых говорах (особенно северных и сибирских) называли болтуна, говорливого или хвастливого человека. Человек мог получить прозвище Бакня за привычку много и красноречиво говорить. Суффикс «-ня» в таких прозвищах характерен для русской народной ономастики (сравните: Воробей — Воробня, Говор — Говорня). Таким образом, Бакнин — это потомок человека по прозвищу Бакня.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с тюркскими корнями. В тюркских языках «бак» означает «смотри», «гляди», а «бакы» — «взгляд» или «судьба». Однако в этом случае фамилия должна была бы звучать как Бакынин или Бакеев, а форма Бакнин указывает на русскую народную переработку. Кроме того, суффикс «-ин» типичен для русских, а не тюркских фамилий, поэтому версия с прозвищем Бакня выглядит куда убедительнее.

Географически фамилия Бакнин встречается крайне редко. Основные следы ведут в центральные и северные области России, где сохранялась старая диалектная лексика. Поскольку фамилия недворянская и не принадлежала известным родам, её носители, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми. Прозвище не указывает на конкретное ремесло, а характеризует личную черту — говорливость, что вполне обычно для бытовых прозвищ в деревне. В современных телефонных справочниках и базах данных фамилия встречается единично, что подтверждает её локальный и древний характер.