Фамилия Бакшайтите звучит для русского уха непривычно и сразу выдает в ее носителе литовские или, шире, балтийские корни. Это женская форма литовской фамилии, образованная по типичной для Литвы модели: мужская фамилия оканчивается на -ас, -ис или -ус, а женская — на -айте, -уте или -ите. В данном случае суффикс -ите указывает на незамужнюю женщину (дочь). Если бы речь шла о замужней женщине, фамилия звучала бы как Бакшайтене. Мужская версия фамилии, от которой все образовано, — Бакшайтис (Bakšaitis).

Основа фамилии — «Бакша» (Bakša). Это литовское прозвище или неканоническое имя, которое, скорее всего, связано с глаголом bakšėti, что означает «стучать», «колотить», «долбить». Так могли прозвать человека по роду занятий: например, плотника, столяра или каменотеса, который постоянно стучал инструментом. Другая, менее вероятная версия, возводит основу к слову bakšas — «толстяк», «пузан», но в ономастике чаще работают с глагольными корнями, описывающими деятельность.

В Литве фамилия Бакшайтите не является широко распространенной, но встречается преимущественно в северных и центральных районах страны, особенно в исторической Жемайтии (Жмуди). Суффикс -айтис характерен именно для жемайтского диалекта, что подкрепляет региональную привязку. Для сравнения: в восточной Литве та же основа могла бы дать фамилию Бакшюс или Бакшавичюс.

По сути, фамилия Бакшайтите — это «дочь стукача» или «дочь плотника». Она недвусмысленно указывает на ремесленные корни предка по мужской линии. В русском контексте, куда фамилия могла попасть вместе с литовскими переселенцами в XIX–XX веках, она сохранила свое литовское окончание, не склоняясь по падежам, что типично для фамилий на -ите.