Фамилия Бактыбергенова ведёт начало от мусульманского мужского имени Бактыберген. Как и большинство имен восточного происхождения, имя Бактыберген имеет сложную основу. Первая часть этого имени восходит к древнетюркскому слову «бакты», которое в переводе на русский язык означает «ребенок родился». Вторая часть имени происходит от казахского слова «берген», то есть «данный» или «подаренный кем-либо». Таким образом, один из вариантов перевода этого имени звучит как «подаренный ребенок». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Бактыбергеновых можно лишь на основании генеалогических исследований.