Фамилия Бакытжан стоит особняком в русском ономастиконе — она не славянская по происхождению, а тюркская, и образована не по моделям «-ов/-ев» или «-ин», а представляет собой полное личное имя, перешедшее в фамилию без изменений. Это типично для фамилий народов Центральной Азии, особенно казахов, где родовые имена нередко фиксируются в документах как фамилии в советский период.

Основа фамилии — казахское мужское имя Бакытжан. Оно составное: «бакыт» переводится как «счастье», «удача», а «жан» — «душа», «человек», «дорогой» (восходит к персидскому «джан»). В сумме имя означает «счастливая душа» или «дорогой, как счастье». Это типичное для тюркской антропонимики двухосновное имя с пожелательным смыслом — родители надеялись, что ребёнок проживёт счастливую жизнь.

Фамилия Бакытжан бытует почти исключительно в Казахстане и среди казахской диаспоры. В русскоязычной среде она встречается редко и воспринимается как нерусская. Её носители — потомки людей, чьи отцы или деды носили это имя, и в 1930–1940-е годы, при массовой паспортизации, оно было записано как фамилия. Это объясняет, почему у фамилии нет типичных русских суффиксов: она застыла в форме имени.

С точки зрения словообразования интересно, что фамилия оканчивается на согласный, но склоняется по правилам русского языка как существительное мужского рода (Бакытжан, Бакытжана, Бакытжану). Женский вариант фамилии звучит так же и не склоняется, если носительница — женщина. Социального или сословного оттенка у фамилии нет: её носили и крестьяне, и кочевники-скотоводы, и городские жители.

Единственная сложность — путаница с ударением. В казахском языке ударение обычно падает на последний слог, поэтому правильное произношение — Бакытжа́н, хотя в русской речи иногда смещают ударение на первый слог. Фамилия не имеет однокоренных вариантов в русской среде, но среди казахских фамилий встречаются параллели: Бакыт, Жанбакыт, Бакытбай — все они построены вокруг того же корня «бакыт».