Фамилия Балберовы происходит от прозвища Балбер. В его основе лежит слово «балбера», означавшее поплавок для рыболовной сети, который вырезали из дерева или коры. Этим же словом называли и простейшее пугало для птиц в садах — дощечку с подвесными балберками, которые стучали на ветру. Поэтому предок Балберовых мог быть рыбаком, изготовителем поплавков или огородником, делавшим трещотки для отпугивания птиц.

Есть и вторая версия, связанная с диалектным глаголом «балберничать». В тамбовских говорах так говорили о человеке, который шатается без дела и дурит. Если прозвище пошло от этого глагола, то оно указывало не на ремесло, а на характер и поведение родоначальника.

Фамилия образована по самой распространённой русской модели: к основе Балбер добавили суффикс -ов. Получилось отчество-фамилия, буквально означающее «сын Балбера». Эта модель типична для большинства русских фамилий, сложившихся в XV–XVII веках. Поскольку слово «балбера» — общеславянское, схожие по корню фамилии (Балберов, Балберин, Балберкин) могут встречаться в разных регионах, но точное место и время появления именно фамилии Балберов установить пока не удаётся.