Фамилия Балошкина — женская форма фамилии Балошкин, и её происхождение связано с прозвищем или именем, в основе которого лежит слово «бал» или «бала». В русских говорах «бала» могло означать «болтун», «пустомеля» или «шутник» (от глагола «балакать» — говорить, болтать). Соответственно, Балошкой в старину могли прозвать человека говорливого или склонного к шуткам, балагурству. Менее вероятна, но возможна связь с тюркским «бал» — «мед», «сладкий»: в таком случае прозвище могло относиться к человеку с приторным, льстивым характером.

Суффикс -к- в основе (Балошк-) — типичный для русских уменьшительно-ласкательных форм личных имён и прозвищ. Сравните: Ивашка, Мишка, а также однокоренные фамилии Балашов, Балакин, Балов. Фамилия Балошкин образована по патронимической модели: сначала от прозвища Балошка возникло отчество «Балошкин сын», которое со временем закрепилось как фамилия. Окончание -а указывает на принадлежность женщине — дочери или жене Балошкина.

Географически фамилия встречается преимущественно в центральных и южных регионах России, особенно в Тульской, Рязанской и Воронежской областях, что подтверждает её происхождение из среды великорусского крестьянства. В документах XVII–XVIII веков носители фамилии могли быть записаны как «Балошкины» — с двойным написанием через «о» или «а» (Балашкин), но вариант с «о» считается более архаичным.

С точки зрения социального статуса, предки современных Балошкиных, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми. Фамилия не относится к дворянским и не фиксируется в родословных книгах, что типично для прозвищных фамилий, возникших в среде простого народа.