Фамилия Балошкин — редкий пример, где суффикс -ин указывает на происхождение от прозвища, оканчивающегося на -а или -я, но при этом основа не женского, а мужского рода. В русских фамилиях -ин обычно присоединяют к основам на -а/-я (Гаврила — Гаврилин, Кузьма — Кузьмин), но здесь мы видим «Балошк-», которое, скорее всего, произошло от имени или прозвища Балошка. Такая форма — типичный уменьшительно-ласкательный вариант от имени Валентин или Владимир через народное «Баля», «Балоша», либо от редкого канонического имени Валлис (в бытовой речи могло трансформироваться в «Баля»). В любом случае, фамилия образована по модели «чей сын?»: «сын Балошки» — Балошкин.

Корень «бал-» в народной речи мог иметь несколько значений. Самое вероятное — от глагола «балакать» (говорить, болтать) или «баловник» (проказник, шалун). В северных и вологодских говорах «балошка» — это не только уменьшительное имя, но и прозвище для бойкого, разговорчивого человека, иногда с оттенком «озорник». В словаре В. И. Даля «баловство» и «баловень» — прямые родственники, так что прозвище Балошка мог получить ребенок или взрослый с живым, непоседливым характером.

С географической точки зрения фамилия Балошкин встречается крайне редко. Основные очаги — центральные области России, в частности Тверская и Ярославская губернии, где в метрических книгах XIX века фиксируются единичные крестьянские семьи с такой фамилией. В некоторых списках она соседствует с однокоренной фамилией Балошков, где суффикс -ов указывает на основу на согласный (Балошко). Разница в окончании — результат местных диалектных особенностей: на севере чаще говорили «Балошка» (отсюда -ин), на юге — «Балошко» (отсюда -ов).

Есть и вторая, менее очевидная версия: основа могла быть связана с тюркским «балык» (рыба) через прозвище Балык, которое в русском языке обросло уменьшительным суффиксом -ошк- (Балык → Балыкошка → Балошка). Но это маловероятно, так как в русских документах фамилия не имеет устойчивой связи с рыболовством или южными регионами, где такое заимствование было бы оправдано. Более правдоподобно происхождение от славянского глагола «балить» (шутить, дурачиться) — тогда Балошка — это «шутник» или «балагур».

Таким образом, предки носителей фамилии Балошкин в большинстве случаев были людьми с живым характером, возможно, сельскими балагурами или просто людьми, чье прозвище закрепилось за родом. Фамилия недворянская, крестьянская, и ее редкость говорит о том, что родословная, скорее всего, локальная и нешироко разветвленная.