Фамилия Балпеисов — редкий пример, где основа почти прозрачна, но требует этнической и языковой настройки. Она образована по стандартной русской патронимической модели: к основе Балпеис- добавлен суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Балпеиса). Вариация с суффиксом -ев здесь невозможна, так как основа оканчивается на твёрдый согласный.

Корень фамилии — составное личное имя Балпеис. Оно явно тюркского происхождения, скорее всего казахского или башкирского. Первая часть «бал» в тюркских языках означает «мёд», но в составе имён часто имеет переносное значение «сладкий», «дорогой», «любимый» (ср. казахское Балжан — «сладкая душа»). Вторая часть «пеис» (или «бейис») — это искажённое арабское «Байс» или, что вероятнее, казахское «бейіс» — «рай». Целое имя Балпеис можно перевести как «сладкий рай» или «райская услада». Это классическое имя-пожелание: родители давали его ребёнку, чтобы его жизнь была сладкой и благословенной.

Фамилия Балпеисов — относительно молодая в масштабах истории русских фамилий. Она не могла возникнуть раньше, чем у тюркских народов вошло в обиход закрепление наследственной фамилии по отцу, что в Казахстане и Средней Азии массово произошло только в советское время, в 1920–1930-е годы. Поэтому искать древних дворян или купцов с этой фамилией не стоит — её носители в подавляющем большинстве потомки скотоводов, земледельцев или сельских жителей, получивших фамилию по имени деда или отца при паспортизации.

Географически фамилия тяготеет к северо-западу Казахстана и прилегающим регионам России (Астраханская, Оренбургская области). Встречается она и в Башкортостане, где «бал» также активно используется в именах. Интересно, что в русской транскрипции возможны варианты написания «Балпейсов» (через «й»), но форма «Балпеисов» — более точная передача тюркского произношения.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Балпеисов стоит в одном ряду с Балтабаевым, Балгазиным, Балмухановым — все они образованы от имён с компонентом «бал». Но именно «Балпеисов» выделяется редкой второй частью: «пеис» встречается в фамилиях гораздо реже, чем, скажем, «бай» или «бек». Это делает фамилию хорошим маркером для генеалогического поиска — она сразу указывает на конкретный регион и, возможно, на относительно небольшой род.