Фамилия Балпуков — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от фамилий, образованных от распространённых имён или профессий, здесь мы сталкиваемся с неочевидной основой и, скорее всего, с искажением исходного слова.

В основе фамилии лежит прозвище или, что вероятнее, искажённое тюркское имя. Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования: «сын человека по прозвищу Балпук». Само слово «Балпук» в русском языке не встречается. Наиболее логичная версия — это фонетическая или грамматическая адаптация тюркского составного имени. Например, от «Бал» (мёд, сладкий, или, в переносном смысле, дорогой, любимый) и «пук» — искажённое «бек» (господин, князь). В таком случае исходная форма могла звучать как Балбек или Балпук — «сладкий (дорогой) господин». Подобные имена были характерны для татар, башкир, казахов и других тюркских народов, живших по соседству с русскими.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом. В некоторых говорах «балпук» могло означать неуклюжего, медлительного человека или, наоборот, болтуна (от «балакать»). Однако эта гипотеза слабая, так как не подтверждается ни одним из известных диалектных словарей. Поэтому тюркское происхождение основы остаётся основным.

География фамилии также подсказывает её корни. Фамилия Балпуков встречается в основном на юге России, в Поволжье и в Западной Сибири — в регионах активного смешения славянского и тюркского населения. Предки носителей этой фамилии с большой вероятностью были крещёными татарами или башкирами, перешедшими в православие и получившими фамилию по имени или прозвищу основателя рода. Сословно они относились к государственным крестьянам или однодворцам.

В написании фамилии стоит обратить внимание на букву «у» под ударением. Встречающийся вариант Балпаков (через «а») — скорее всего, ошибка при записи или результат акающего произношения, которое не изменило ударную гласную. Исторически правильная форма — через «у».